玉米籽粒、穗轴花色苷含量两个显性基因的上位性研究与叶脉叶耳颜色的进一步定位毕业论文(编辑修改稿)

玉米籽粒、穗轴花色苷含量两个显性基因的上位性研究与叶脉叶耳颜色的进一步定位毕业论文(编辑修改稿)内容摘要：

ar to groups of cob anthocyanin content sixth chromosome location to the primer S8 near, near tenth chromosome location to the interval variance of the two groups of grain and cob anthocyanin content analysis found that the average content of maize grain and cob anthocyanin significant difference among different genotypes, the average content of different genotypes of grain and cob anthocyanins are also groups of nine genotypes anthocyanin average multiple parisons showed that the AABB aabb AABB AABB four genotypes anthocyanin content difference was not significant, these four genotypes anthocyanin content and AABB aabb aaBB AABB AABB five kinds significant differences in genotype anthocyanin content AABB aabb AABB AABB AABB five kinds of genotype anthocyanin content was no significant when the two genes at the same time the presence of anthocyanin content is relatively large, only one gene action anthocyanins was no significant groups of grain and cob anthocyanin content the two geic epistasis analysis showed that: a gene alone are relatively low impact on the grain and cob anthocyanins, two gene interactions anthocyanins parison gene interaction has a significant role in the improvement of anthocyanin content. 2. Auricles and veins Color group MUSBC4F3 further positioning The MuSBC4F3 phenotypic identification showed veins and auricles nonpurple and purple two phenotypes are 1:3, in Mendel single gene segregation ratio 1:3, can exclude the interference of other genes, the target area. paragraph gene mapping ideal to the F2 and BC4F2 positioning the veins leaves near the ear gene primers and screening efforts, by electrophoresis the BC4F3 differences primer only three order to more accurate positioning results need to design veins positioning interval the IDP8526bnlg1028 and auricles positioning interval IDP8526bnlg1028 vein leaf ears are positioned to the same interval, so the design of the primer as long as there is difference in the veins and leaf auricle can be used to locate in the NCBI blastn that the BAC value IDP8526 the BAC value bnlg1028 , the 2,753,143 bp from that the physical distance between IDP8526bnlg1028, physical distance is too large, need to design new The primer to shorten the physical distance. One by one to find SSRHUNTER SSR loci, to find a single copy of SSR loci Primers were designed using Premier , a total of 25 pairs of primers, primer J34 in the SDM wood polymorphism is better found by out the differences cited material and new design of primers veins leaf ear color further positioning, last veins leaf ears are positioned to J34bnlg1028 interval, the physical Abstract V distance to 1304KB, greatly shorten the physical distance clone basis for the next BC4F3 positioning results phenotypic rate of more than 60%, significantly higher than the the BC4F2 positioning, the positioning of the visible and nearisogenic lines BC4F3 results higher accuracy, higher reliability. 第一章 文献综述 1 第一章 文献综述 数量性状的相关概念 在遗传机制制中，数量性状受多个基因来控制的，数量性状的基因对环境比较敏感，基因的作用与环境条件有关，关于数量性状的多基因假说是：数量性状基因是由多对微效基因联合作用的，各对微效基因的效应差不多，而且可以累加，也可以称这些微效基因为累加基因，由于每对微效基因对表型性状的影响较小，基因太多无法一个一个 去辨认，只能将表型按照多基因体系来进行研究，微效基因之间的显性效应与隐性效应不怎么明显，一般用大写字母表示增效，小写字母表示减效作用。 微笑基因对环境非常敏感，所以数量性状的表型性状容易受环境的影响，微效基因还有多个效果，不仅对数量性状产生作用还对其他别的性状有一定的作用。 微效基因与主效基因间可以重组，连锁等。 数量性状基因与质量性状基因的异同之处：数量性状的变异是连续性的而质量性状的变异是不连续的，数量性状的基因的杂交后代不能明确分组，质量性状的基因的杂交后代可以按孟德尔定律进行分组，数量性状的基因受环境的 影响较大，受环境的变化而变化，遗传力小，不能稳定遗传，而质量性状的基因是可以稳定遗传的。 控制数量性状的基因在特定的时空环境下进明显，行表达，基因的表达因环境而不相同，有的环境表性效果比较明显，有的环境下表型效果不所以，数量性状基因经常存在与环境之间的相互作用。 质量性状的基因受环境影响不明显，可以稳定遗传。 质量性状的基因一般用概率的方法来进行分析也可以用系谱法来分析，数量性状基因的研究需要用统计学和遗传学的方法来研究。 作物的表型是由基因型，基因型与环境的作用和误差三者共同组成的，一般用三者的方差来计算表型的 方差，前两者的方差是可以遗传的，误差方差是不可以遗传的。 数量性状的基因经常存在一因多效的情况，生物体的数量性状间有一定程度的关联，采用协方差分析来分析这种变异情况。 主效基因，微效基因，修饰基因都对数量性状有作用，数量性状的表型受这三种基因的表达，三种基因对数量性状的影响不同，主效基因的影响较大，对数量形状的表型起的作用相对来说比较大，一般情况数量性状是由几个主效基因共同控制的，修饰基因对表型的影响较小，主要是对主效基因起修饰的作用，而微效基因对表型的影响也很小，这些微效基因的作用是可以累加的，对环境很敏感。 基因的加性效应，显性效应，上位性效应的定义分别是，加性效应是等位基因的累加效应，是遗传中可以固定的因素，也称为育种值，显性效应是等位基因之间的互作效应，是遗传中不能固定的因素，可以产生杂种优势。 上位性效应是指不同基因位点内非等位基因间的相互作用。 这三种效应在遗传育种中有不同的效应，加性效应在上下代之间可以稳定遗传，选择的过程中可以累加，可以很快将基因纯和，具有较高加性效应的数量性状通过世代选择容易达到育种的效果，显性效应与杂种优势有密切关系，在杂交育种中加以利用，但是这种西南大学硕士学位论文 2 显性效应在逐代选择的过程中逐渐减 弱最后消失，会影响育种中早代选择的效果，所以在育种中对于以显性为主的数量性状以高代选择为主。 上位性效应是由非等位基因间互作产生的，对数量性状的表型有很大的作用，加性效应加性效应互作产生的上位性效应可以遗传并逐渐固定，加性效应和显性效应产生的上位性效应与杂种优势有关，在低世代的育种时影响数量性状的选择效果。 QTL 定位的原理与方法 定位的原理 数量性状基因座是指控制数量形状的基因在基因组中的位置， QTL 定位的理论依据就是Men 的连锁遗传规律，利用分子标记定位 QTL，分析标记与目标 QTL 间的连锁关系。 用交换律来计算。 常用的分子标记有： RFLP， RAPD,AFLP,SSR,SNP,等， RFLP 早期使用比较多， SSR标记操作简单快捷，标记多态性高，适用于大批量的应用。 定位的方法 通过 QTL与标记间的连锁关系，确定 QTL于标记间的距离并将其定位到遗传图谱上，根据标记数目的不同分为单标记，双标记，多标记。 统计方法有方差分析法，均值分析法，矩估计法，最大似然法。 自 20世纪 60年代初提出单一标记分析方法以来， QTL定位方法有了长足的发展，已经发展了适合不同倍性 [1]。 与同源多倍体 [2]。 、连续性与间断性变量 [3]、静态与动态性状、单一性状与多个相关性状联合 [4]、单个组合与多个组合联合以及两个亲本与多个亲本甚至育成品种群体的 QTL定位方法。 常用的 QTL作图方法主要有单标记分析法，性状标记回归法，性状 QTL回归法，性状 QTL回归法包括单区间作图法（ The interval mapping IM），复合区间作图法（ Composite interval mapping,CIM），多重区间作图法（ Multifold interval mapping MIM），基于混合线性模型的复合区间作图法（ Composite interval mapping based mixed linear model MCIM），完备区间作图法（ Inclusive Composite Interval Mapping,ICIM）。 区间作图法（ The interval mapping IM） 是由个体目标性状观察值与双侧分子标记建立的线性模型的基础上，利用最大似然法，对标记区间内的某一点可能存在的 QTL 进行检测，进而获得极大似然估计值。 其遗传假设是，数量性状遗传 变异只受一对基因控制，表型变异受 遗传效应 （固定效应） 和剩余误差（随机效应） 控制，不存在基因型与环境的互作。 区间作图法可以估算 QTL 加性和显性效应值。 与单标记分析法相比，区间作图法具有以下特点：能从支撑区间推断 QTL 的可能位置；可利用标记连锁图在全染色体组系统地搜索 QTL,如果一条染色体 上只有一个 QTL，则 QTL 的位置和效应估计趋于渐进无偏； QTL 检测所需的个体数大大减少。 但 IM 也存在不足： QTL 回归效应为固定效应；无法估算基因型与环境间的互作（ QE ），无法检测复杂的遗传效应（如上位第一章 文献综述 3 效应等）。 当相邻 QTLs 相距较近时，由于其作图精度不高， QTLs 间相互干扰导致出现 Ghost QTL；一次只应用两个标记进行检查，效率很低。 复合区间作图法（ Composite interval mapping,CIM） 是 Zeng[5] 提出的结合了区间作图和多元回归特点的一种 QTL 作图方法。 其遗传假定是，数量性状受多基因控制。 该方法中拟合了其他遗传标记，即在对某一特定标记区间进行检测时，将与其他 QTL 连锁的标记也拟合在模型中以控制背景遗传效应。 CIM 主要优点。