国家人类重大疾病的蛋白质组学研究开发计划(编辑修改稿)

国家人类重大疾病的蛋白质组学研究开发计划(编辑修改稿)内容摘要：

，肥大 /增生和异常分化过程中蛋白质组的变化；比较分析心血管疾病发生发展过程中血样的蛋白质谱，深入认识心肌肥大、心肌梗死及高血压、动脉粥样硬化等重要心血管疾病的发病机理，发现和鉴定可供疾病预警和诊断的标志性蛋白质及进行 药物研发的靶标分子。  利用已建立的中国人心血管健康资源库及心血管病病人的样品库，分析其在不同健康状况下的蛋白质谱。  动态观察心肌细胞 /血管内皮细胞氧化应激发生及其所致心肌细胞凋亡、肥大等过程和血管内皮细胞凋亡、增生及异常分化等过程中的蛋白质组变化。  研究心血管细胞损伤相关蛋白质的相互作用，发掘高血压、心肌肥大、动脉粥样硬化、心力衰竭及心肌梗死等重要心血管疾病病理过程的关键蛋白，进而发现可供疾病预警和诊断的标志性蛋白质及进行药物研发的药靶分子。 承担单位： 北京诺赛基因组研究中心有限公司 、 军事医学科学院环境医 学研究所 课题负责人及主要学术骨干： 姚志建 、 钱令嘉 、顾东风、 唐建国 课题 8. 肿瘤发生与转移相关的功能蛋白质组学研究 应用我国特色的人源肿瘤细胞株系和组织样品，采用 2DE 等蛋白质组技术，特别 通过高分辨的蛋白质分离、纯化和鉴定技术 进行比较蛋白质组分析 ， 绘制不同时程、不同逆转（应用分化诱导剂或肿瘤转移抑制药物）状况下肿瘤转移相关的功能蛋白质群，发现可用于恶性肿瘤预警、早期诊断和治疗靶标的关键蛋白质。  应用我国特色的人源肿瘤（如白血病，鼻咽癌），发现肿瘤转移相关的蛋白质群及其相互作用网络；  比较不同时程、不同状 态肿瘤病人血样、尿样的蛋白质组规律性变化，发现可用于恶性肿瘤预警、早期诊断、治疗靶标的标志蛋白； 承担单位： 湖南师范大学 课题负责人及主要学术骨干： 梁宋平 、黄秋花、丁彦青 专题 4: 蛋白质组的生物信息学研究 预期目标： 研发大规模、高通量的蛋白质组数据自动化注释系统， 建立与蛋白质组学研究相关并与国际相关数据库接轨的数据库及其服 务体系。 课题 9. 蛋白质组的生物信息学研究与系列数据库的建立 建立蛋白质组系列数据库 与服务系统 ，包括：通用数据库、结构域数据库、二维电泳图数据库、翻译后修饰数据库、三维结构数据 库、集成基因组数据库、代谢通路数据库、知识库等。 开展 人类 蛋白质 组的信息结构分析 、 功能 蛋白质 组相关信息分析。 进行蛋白质组的 生物信息学新理论、新方法 研究，发展 新技术、新软件， 进行 若干重要算法的比较分析。  蛋白质组系列 数据库与服务系统 的 建立。  蛋白质 组的信息结构分析 及 生物信息学 数据分析方法研究。  蛋白质组 转录 组相关信息 的对比 分析。  蛋白质组数据分析的标准化和实验室信息管理系统研究。  大规模、高通量的蛋白质组数据自动化注释系统研发。  蛋白质组功能连锁群理论模型建立。 承担单位： 中国科学院上海生命科学研究院、 军事医学科学院放射医学研究所 课题负责人及主要学术骨干： 李亦学 、 朱云平 、 缪有刚 主要研究内容调整如下： 以严重影响我国人群健康的重大疾病（如肝炎、肝癌疾病）为对象，研究和发掘一批与上述疾病发生发展密切相关的蛋白质群 ,分别用比较蛋白质组技术研究肝炎病毒感染 肝硬变 肝癌的蛋白质组，研究和建立与重大疾病相关的功能蛋白质组数据库；研究具有基因表达谱研究基础的肝脏和肝脏疾病的重要生理 /病理体系或过程的蛋白质连锁群。 选择与人类重大疾病和人类重要生命活动紧密相关的系统、器官、 细胞，如已有转录组基础的胎肝和造血 CD34+细胞体系， 研究这 2种组织和细胞系的重要生理 /病理体系或过程的蛋白质表达谱和蛋白质连锁群。 阐明胎肝、造血系统基因转录和翻译调控的规律及其生理意义，发现并确认一批人源新基因，建立功能蛋白质群及其蛋白质功能连锁图和物理连锁图，并揭示其对造血系统功能的影响。 发现或确认 500 种以上人类新型蛋白质，探索蛋白表达的群集调控规律和蛋白质相互作用网络。 并以上述胎肝和病肝研究建立的相关蛋白质表达谱和蛋白质连锁图为基础，研究和探索重大疾病发生发展的规律和机理，探索适当的干预措施的可能 性，为重大疾病的防诊治提供新的预警、诊断标志物和新的药物靶标。 建立和完善具有国际先进水平的高通量、高灵敏度、高准确性、高稳定性的蛋白质组学研究技术平台。 建立高通量、特异性蛋白质组样品制备方法，完善二维凝胶电泳 生物质谱的高通量和自动化技术以及大规模的修饰蛋白质组技术和定位技术。 研究和发展混合蛋白的二维阵列色谱 质谱 /激光荧光分离和鉴定新技术、中孔分子筛基质的 MALDI 新 技术、混合肽的多维色谱 /电泳高效分离和质谱高灵敏鉴定技术；建立大规模、高通量获取蛋白质组功能和相互作用谱及蛋白质连锁群的新技术，重点研究高 通量酵母双杂交筛选系统，发展新的可用于蛋白质相互作用分析的光谱 /电化学 /质谱技术体系。 应用上述平台支持人类肝脏蛋白质组和肝脏疾病蛋白质组的研究。 建立和完善蛋白质组学研究的生物信息学技术体系、蛋白质组系列数据库、蛋白质组功能连锁群分析的理论模型及相应算法，包括：通用数据库、结构域数据库、二维电泳图数据库、翻译后修饰数据库、三维结构数据库、集成基因组数据库、代谢通路数据库、知识库等。 开展 功能蛋白质信息结构与功能分析、 生物信息学新理论、新方法 研究，发展 新技。