生物化学维生素与辅酶章节考点总结(编辑修改稿)内容摘要:

ZDNA的比较 B— DNA:典型的 WatsonCrick 双螺旋 DNA 右手双股螺旋 每圈螺旋 个碱基对 每对 螺旋扭角 36176。 螺距: 碱基倾角: 1176。 ADNA 在相对湿度 75%以下所获得的 DNA纤维。 ADNA也是右手双螺旋,外形粗短。 RNARNA、 RNADNA杂交分子具有这种结构。 ZDNA 左手螺旋的 DNA。 天然 BDNA的局部区域可以形成 Z0DNA。 DNA 三股螺旋 在多聚嘧啶和多聚嘌呤组成的 DNA螺旋区段,序列中有较长的镜像重复时,可形成局部三股螺旋,称 HDNA。 镜像重复: TAT 配对 C+GC 酸对 DNA 的三链结构常出现在 DNA 复制、重组、转录的起始或调节位点,第三股链的存在可能使一些调控蛋白或 RNA聚合酶等难以与该区段结合,从而阻遏有关遗传信息的表达。 四、 环状 DNA 生物体内有些 DNA是以双链环状 DNA的形式存在,包括: 某些病毒 DNA 某些噬菌体 DNA 某些细菌染色体 DNA 细菌质粒 DNA 真核细胞中的线粒体 DNA、叶绿体 DNA 环形 DNA 的不同构象 P340 图 58 松驰环、解链环、负超螺旋 ( 1)、 松弛环形 DNA 线形 DNA直接环化 ( 2)、 解链环形 DNA 线形 DNA拧松后再环化 ( 3)、 正超螺旋与负超螺旋 DNA 线形 DNA拧紧或拧松后再环化,成为超螺旋结构。 绳子的两股以右旋方向缠绕,如果在一端使绳子向缠紧的方向旋转,再将绳子两端连接起来,会产生一个左旋的超螺旋,以解除外加的旋转造成的胁变,这样的超螺旋叫正超螺旋。 如果在绳子一端向松缠方向旋转,再将绳子两端连接起来,会产生一个右旋的超螺旋,以解除外加的旋转所造成的胁变,这样的超螺旋称负超螺旋。 对于右手螺旋的 DNA分子,如果每圈初级螺旋的碱基对数小于 ,则其二级结构处于紧缠状态,是正超螺旋。 如果每圈初级螺旋的碱 基对数大于 ,则其二级结构处于松缠状态,是负超螺旋。 环形 DNA 的拓扑学特性 以 260bp 组成的线形 BDNA为例,螺旋周数 260/=25。 P340 图 258 松驰环、解链环、负超螺旋 ①连环数( L) DNA双螺旋中,一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数,以 L 表示。 松驰环: L=25 解链环: L=23 超螺旋: L=23 ②缠绕数( T) DNA分子中的 WatsonCrick 螺旋数目,以 T 表示 松驰环 T=25 解链环 T=23 超螺旋 T=25 ③超螺旋周数(扭曲数 W) 松驰环 W=0 解 链环 W=0 超螺旋 W= 2 L=T+W ④比连环差( λ) 表示 DNA的超螺旋程度 λ=( L— L0) /L0 L0 是指松驰环形 DNA的 L 值 天然 DNA的超螺旋密度一般为 ~,平均每 100bp 上有 39 个负超螺旋。 负超螺旋 DNA 是由于两条链的缠绕不足引起,很易解链,易于参加 DNA 的复制、重组和转录等需要将两条链分开才能进行的反应。 拓扑异构酶 此酶能改变 DNA拓扑异构体的 L 值。 ①拓扑异构酶酶 I(拧紧) 能使双链负超螺旋 DNA转变成松驰形环状 DNA,每一次作用可使 L 值增加 1,同时,使松驰环状 DNA转变成正超螺旋。 ②拓扑异构酶酶 II(拧松) 能使松驰环状 DNA 转变成负超螺旋形 DNA,每次催化使 L 减少 2,同时能使正超螺旋转变成松驰 DNA。 五、 染色体的结构 大肠杆菌染色体 大肠杆菌染色体是由 106bp 组成的双链环状 DNA分子,约 3000 个基因。 大肠杆菌 DNA结合蛋白: 每个细胞 H 两个 28KD 的相同亚基 30000 个二聚体 HU 两个各 9KD 的 不同亚基 40000 个二体聚体 HLP1 17KD 的亚基 20200 个单体 P 3KD 的亚基 未知 这些 DNA结合蛋白,使 106bp 的 DNA压缩成为一个手脚架形结构,结构中心是多种 DNA结合蛋白, DNA双螺旋分子有许多位点与这些蛋白结合,形成约 100个小区,每个小区的 DNA 都是负超螺旋,一个小区的 DNA 有两个端点被蛋白质固定,每个小区相对独立。 图 用极微量的 DNA 酶 I 处理时,只能使少量小区的 DNA 成为松驰状态,而其它小区仍然保持超螺旋状态。 真核生物染色体 主要由组蛋白和 DNA组成。 组蛋白是富含碱性 (Lys、 Arg)的碱性蛋白质,根据 Lys/Arg 比值不同,可分为 HH2A、 H2B、 H H4 五种,均为单链蛋白质,分子量 1100021000。 H2A、 H2B、 H H4 各两分子对称聚集成组蛋白八聚体。 146bp 长度的 DNA双螺旋盘绕在八聚体上形成核小体。 核小体间 DNA长度 15100bp(一般 60bp)其上结合有 H1 图 2H2A、 2H2B、 2H 2H4 组蛋白八聚体 146bpDNA 核小体 串联 染色质 折叠 染色体 DNA(直径 2nm) 盘绕组蛋白八聚体上,结合 H1,压缩比 1/7 核小体(一级结构) 螺旋化,压缩比 1/6 螺线管(二级结构) 再螺旋化,压 缩比 1/40 超螺线管(三级结构) 折叠,压缩比 1/5 染色单体(四级结构) 总压缩比: 1/8400~1/10000 六、 DNA 的生物学功能 首次直接证明 DNA的遗传功能的是 Avery 的肺炎双球菌转化实验。 P342 1~4 Avery 的肺炎双球菌转化实验 第三节 RNA的结构 一、 RNA 的一级结构 RNA是 AMP、 GMP、 CMP、 UMP 通过 3/、 5/磷酸二酯键形成的线形多聚体。 P343 图 510 RNA基本结构 ① 组成 RNA的戊糖是核糖 ② 碱基中 RNA的 U 替代 DNA中的 T,此外, RNA中还有一些稀有碱基。 ③ 天然 RNA分子都是单链线形分子,只有部分区域是 A型双螺旋结构。 双螺旋区一般占 RNA分子的 50%左右。 二、 RNA 的类型 细胞中的 RNA,按其在蛋白质合成中所起的作用,主要可分为三种类型。 核糖体 RNA rRNA 转运 RNA tRNA 信使 RNA mRNA 此外,真核生物细胞中有少量核内小 RNA( small nuclear RNA snRNA) P344 表 57 大肠杆菌中的 RNA 沉降系数:单位离心场中的沉降速度,以 S 为单位,即 1013 秒。 如 23S rRNA ,单位离心场中沉降 23 1013 秒 5S rRNA ,单位离心场中沉降 5 1013 秒 三、 tRNA 的结构 tRNA约占全部 RNA的 15% 主要功能:在蛋白质生物合成过程中转运氨基酸。 已知一级结构的 tRNA有 160 种,每种 tRNA可运载一种特定的 ,一种 或多种 tRNA运载。 结构特点 ①分子量在 25kd 左右, 7090b,沉降系数 4S 左右 ②碱基组成中有较多稀有碱基 图 ③ 3’末端为„ CpCpAOH,用来接受活化的氨基酸,此末端称接受末端。 ④ 5’末端大多为 pG„或 pC„ ⑤二级结构是三叶草形 P345。
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