用户手册-武汉理工大学

用户手册-武汉理工大学内容摘要：

HN H 2N H 2 注意： 当使用电荷按键 给一个非金属原子加电荷时，相应的氢原子数目会自动增加或减少，以保持合理的原子价。 如果改变一个金属原子的电荷数，电荷会自动根据此原子增加或减少到下一个相应合理的原子电荷数。 显示原子特性 如果想显示此结构式中某一原子的原子价或同位素原子量，或者改变此原子的字体与大小，则可以通过以下方法实现： ? 首先单击选择 /移动 Select/Move按键 ? 然后双击你想改变的原子，打开原子特性对话框。 ? 七个按键 ，依次改变以下设定： C— 原子符号特性 H— 伴随的氢原子特性、大小、位置等 n— 氢原子个数的特性。 q— 电荷特性 V— 原子价特性 I— 同位素原子量特性 N— 全部分子的原子个数特性 当改变设定后，单击 Apply即应用于所绘分子上。 5． 2维优化 软件具有优化功能，可以将所绘结构式重新设定最佳键长与键角，很容易画出很漂亮的结构式。 建环烷结构 按以下方法，可以很容易构建如下非常漂亮的环烷 转到 模式，先按 Ctrl+A与 Del键，删除以前所绘制的所有东西。 1. 选择绘制链 Draw Chains 工具按钮，在绘图区绘出九元链，注意拖动鼠标时显示出碳原子数，产生如下结构： 2. 单击鼠标右键，快速转换至普通绘制 Draw Normal模式 ，从第一个碳原子拖动鼠标至最后一个碳原子，用一个单键连接起它们。 3. 单击优化结构 Clean Structure按键 ，得到以下结构： 构建环肽 使用优化结构按键构建环肽 TyrAlaTrp。 转到 模式，先按 Ctrl+A与 Del键，删除以前所绘制的所有结构。 1. 从 模板窗口 Template Window 选择 表 2. 从氨基酸表中，选择 Tyrsine，在绘图区中单击以拷贝此结构 3. 从原子基团表 中分别选择 Alanine 与 Tryptophan ，在所指原子上单击以连上这些原子基团。 4. 单击鼠标右键以快速转换到 Select/Move模式，从 NH2拖动鼠标至 OH原子团，如下图所示： 5. 单击优化结构 Clean Structure按键 ，得到以下结构： 6 3D优化 注意：在做这部分练习时，在 Options 菜单的 Preferences 对话框中的Structure表中取消 Add Hydrogens 选项。 绘制双环 [2,2,2]辛烷 转到 模式，先按 Ctrl+A与 Del键，删除以前所绘制的所有结构。 1. 从原子基团表 中选择正己烷 ，在绘图区中单击，放置一个己烷环。 2. 单击 Draw Normal 按键，按如下步骤拖动鼠标绘出碳链。 3. 单击 3D优化 3D Optimization工具 得到一个所绘结构的 3D模型。 注意：若在绘图区有不止一个结构式，则先用选取工具选取所要优化的结构式。 4. 单击 3D旋转 3D Rotation 工具，将鼠标移动至结构式上的任何一个原子或键位上，拖动鼠标，直至结构式显示如下： 注意： 1. 如果在 Options菜单的 Preferences对话框中的 Structure表中的 3D Rotation模式被选中的话，在 3D Optimization完成后，自动转到3D Rotation模式。 2. 你可以选择被压住的键是否断开（如上图）或不断。 只要在 Option菜单中的 Preferences 对话框中的 Structure 表选择 Enable bonds intersections 或不选择即可。 3. 你可以将被压住的键移至上层 或将上层的键移至下层，只需在Option菜单中选择 Bring Bond to Front或 Send Bond to Back命令。 更简单的方法是单击改变位置 Chang Position按钮使之激活，按住Shift键再单击被压住的键使之提前。 绘制 triptycene 转到 模式，先按 Ctrl+A与 Del键，删除以前所绘制的所有结构。 1. 按照上述方法绘制双环 [2,2,2]辛烷或从模板窗口 Template Windows 中选择双环 表中的双环 [2,2,2]辛烷复制到绘图区。 2. 从原子基团表 中选择苯环 3. 单击 a键生成如下结构： 4. 依次单击 b， c生成如下结构： 5. 单击 3D Optimization键得到一个优化的所绘结构的 3D模型。 6. 单击 3D旋转 3D Rotation 工具，将鼠标移动至结构式上的任何一个原子或键位上，拖动鼠标，直至位置满意为止。 7. 在工具 Tool菜单中选择 Show Aromaticity命令以显示芳香环。 绘制立方体结构 1. 转到 模式，先按 Ctrl+A 与 Del键 ，删除以前所绘制的所有结构。 2. 从原子基团表 Table of Radicals 中选择环丁烷 ，在绘图区中单击两次以放置两个四元环，一个在另一个上面。 3. 选择普通绘制工具按钮，依次连接两个环丁烷的对应原子，如下： 4. 单击 3D Optimization 按键得到所绘结构的 3D模型。 5. 单击 3D旋转 3D Rotation 工具，将鼠标移动至结构式上的任何一个原子或键位上，拖动鼠标，直至位置满意为止。 绘制正十二面体 C20 转到 模式，先按 Ctrl+A与 Del键，删除以前所绘制的所有结构。 1. 从原子 基团表 Table of Radicals 中选择环戊烷，在绘图区中放置一个环戊烷。 2. 用鼠标在环戊烷的每一个键位上单击以生成其它五个环。 3. 单击鼠标右键以快速转换至选择 /移动 Select/Move工具 4. 按下图移动 a,c,e,g,i原子分别到 b,d,f,h,j原子 5. 在原子工具条中选择碳原子按键，在下图箭头所指位置单击 ,生成甲基。 6. 通过拖动鼠标连接相邻的甲基碳原子，得到以下结构： 7. 单击 3D Optimization 按键得到所绘结构的 3D模型。 8. 单击 3D旋转 3D Rotation 工具，将鼠标移动 至结构式上的任何一个原子或键位上，拖动鼠标，直至位置满意为止，如下图： 7 模板的应用 ACD/ChemSketch包括以下 3种结构模板： ? 原子基团表 ? 模板窗口 ? 即时模板工具 对原子基团表中的模板原子团来说，其与其它原子团结合的原子是固定的，而模板窗口与即时模板工具中的模板，可以在选取时用鼠标单击想要连接的原子即可。 有几种方法可以将模板连接到一个所绘结构。 ? 将模板与所绘化学结构式的化学键溶合：选定模板后，将鼠标指针指向所要溶合的键，出现溶合键位的灰色模板，然后单击鼠标。 ? 将模板通过单键连接到所绘化学结 构式的某一原子：选定模板后，将鼠标指针指向所要连接的原子，出现模板灰色图，然后单击鼠标左键。 ? 将模板直接连接到所绘化学结构式的某一原子：选定模板后，一直按住 Shift键，将鼠标指针指向所要连接的原子，出现模板灰色图，然后单击鼠标左键。 注意： 在单击鼠标左键前，可以通过按 Tab键翻转模板灰色图，以达到一个满意的位置，再单击鼠标。 ACD/ChemSketch提供了一个非常方便的方法管理模板文件：不仅包括软件包中所带的模板，而且包括你自己创建的模板文件。 只需花少量时间便可以将你的文件存为模板文件。 注意在模板文 件与普通文件之间的唯。